בשיעורו השבועי במוצאי שבת חשף מרן הראשון לציון הגאון רבי יצחק יוסף שליט"א שיחה אישית שלא התפרסמה עד כה, שנערכה בינו לבין אחיו הגדול, רבי יעקב יוסף זצ"ל, כשבוע לפני פטירתו.
לדברי הראש"ל, במהלך ביקורו אצל אחיו בתקופת חוליו התפתח ביניהם דיון סביב השאלה מיהו גדול הבקיאים בדור לאחר הסתלקותו של מרן רבי עובדיה יוסף זצ"ל.
"התווכחתי עם חכם יעקב, אחי, שבוע לפני פטירתו", סיפר. "אני טענתי שהחכם בעל 'נר יהודה' – הגאון רבי יעקב חיים סופר – הוא הבקיא ביותר. אין כיום אף אחד בדור בקיא כמותו".
בהמשך הרחיב הראש"ל בשבחו של בעל ה"נר יהודה" ותיאר את היקף ידיעותיו: "אין אף אחד בדור בקיא ככה בכל האחרונים, מדהים. יש לו ספר על התורה עב כרס, ותענוג לקרוא אותו. רואים את הבקיאות שיש לו שם… זה עושה חשק ללמוד".
עוד שיתף בזיכרון מימי בחרותו, כאשר נהג להגיע בלילות שישי לישיבת תפרח, שם למד הגרי"ח סופר. "אנחנו היינו רגילים לעשות 'משמר' גם בתור בחורים וגם בתור אברכים. אצלנו בישיבה לא היה קפה, וקשה ללמוד בשתיים בלילה בלי כוס קפה. בישיבת תפרח כן היה קפה, אז היינו נוסעים לשם ולומדים".
את דבריו חתם בתיאור התמדתו של הגרי"ח סופר: "הוא תמיד היה יושב בפינה, ולא מוציא את העיניים מהספר. באיזו התמדה! לא סתם כך נהיה כל כך בקיא".
