רבי שמואל אבוחצירא זיע"א נולד בעיר תאפילאלת, היא סג'למאסה שבמרוקו, לאביו הגה"ק רבי אהרן אבוחצירא זיע"א, בנו של מרן האביר יעקב זיע"א. שמו נקרא בישראל על שם ראש השושלת הקדושה רבי שמואל אלבז אבוחצירא זיע"א.
בצעירותו למד בישיבת "אביר יעקב", שעמדה תחת הנהגתם של מרן עט"ר רבי דוד אבוחצירא זיע"א והגה"ק רבי משה אתרג'מאן זיע"א. כבר אז נודע רבי שמואל בשקידתו המופלאה, כאשר לא פסיק פומיה מגירסא והיה עמל בתורה לילה כיום.
על גדלותו בתורה מסופר כי באחת הפעמים נעדר מן הישיבה לתקופה מסוימת, וכששב לבית המדרש נשאל על ידי בני הישיבה לפשר היעדרותו. רבי שמואל הזכיר להם כי קודם לכן למדו גפ"ת ונתקלו בפסוק מן התנ"ך שהוזכר בתלמוד, אך לא מצאו את מקורו. "הרגשתי עלבון", אמר להם, "היאך אפשר ללמוד תורה שבעל פה מבלי לדעת היטב תורה שבכתב". משום כך פרש לתקופה מיוחדת של שקידה בכ"ד ספרי הנ"ך, עד שנעשה בקי בהם עם פירושי רש"י, מצודות, רד"ק וחלק מדברי הרלב"ג.
מלבד בקיאותו הרחבה בתנ"ך, היה בקי בשישה סדרי משנה עם הרע"ב ושאר מפרשים, והקפיד במשך ימי חייו ללמוד י"ח פרקי משנה מדי לילה. כן נודע בבקיאותו העצומה בחושן משפט, עד שהיה יודע את הדברים בעל פה ומתקן את הלומדים עמו גם ללא ספר פתוח לפניו.
אף שסירב לקבל על עצמו תפקידי רבנות ומשרה, בפרט לאחר האסון הנורא בפטירת מרן רבי דוד אבוחצירא זיע"א, מעמדו בעיר היה כמנהיג ודיין, אף שהיה נחבא אל הכלים ובורח מכל שררה. יודעי דבר העידו כי רבי שמואל היה סמל של ביטחון בה', וכי גם בעת דוחק ועניות לא ניכרה על פניו דאגה כלל, אלא שמחה של אמונה ותמימות בה'.
ביום י"ט באייר, ל"ד לעומר, שנת תשט"ו, נתבקש רבי שמואל אבוחצירא זיע"א לישיבה של מעלה. תושבי ארפוד הוכו בתדהמה, וכל בני העיר נטלו חלק במסע הלוויה. תלמידי התלמוד תורה פסקו מלימודם, בעלי החנויות סגרו את עסקיהם, והעיר כולה חלקה כבוד אחרון לדמות ההוד שהיתה לסמל של "תמים תהיה עם ה' אלוקיך" ו"הצנע לכת".
מנוחתו כבוד בבית העלמין בארפוד שבמרוקו, וזכרו הטהור נישא בפי יודעי שמו ומוקירי זכרו לדורות.
מצורף תיעוד מיוחד של שירת השיר המרגש 'יה מרנא' על ציונו הקדוש של רבינו שמואל זיע"א, כולל הטקסט המלא עם פירוש:
יָהּ מָרְנָא דְבִשְׁמַיָּא.
ה', אדוננו שבשמים.
לָךְ עֵינָא זְקִיפָא תַלְיָא.
אליך נשואות עיניים מורמות ותלויות.
שְׁזֵיב לָנָא מִבֵּין עַמְמַיָא.
הצל אותנו מבין האומות.
בְּדִיל שְׁמָךְ מַלְכָּא דְּקֻשְׁטָא:
למען שמך, מלך האמת.
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
עֲבֵד עִמָּנָא אָת לְטָבָא.
עשה עמנו אות לטובה.
יָאוּת לָךְ אַתְּ [מַלְכָּא] רַבָּא.
ראוי לך, המלך הגדול.
לִשְׁבֹּק חֶטְאָה רַבָּא וְחוֹבָא.
למחול על חטאים ועוונות גדולים.
יְדָךְ רַבְרְבָא וְשַׁלִיטָא:
כי ידך גדולה ושולטת בכל.
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
קְרִיבִין דִידָךְ אֲנָן מַלְכָּא.
קרוביך אנחנו, המלך.
אֵיכְדֵין הַשְׁתָּא הָוֵי אִפְּכָא.
ואיך עכשיו נהפך המצב?
שַׁנְאָה אָמַר פָּרְקָן לֵיכָּא.
השונא אומר שאין גאולה.
שָׁקִיל מִנַּן אוּף מַרְטוּטָא:
ולוקח מאיתנו אפילו סמרטוט קטן.
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
בְּדִיל שְׁכִינְתָּךְ מָרָן סְכֵי.
למען שכינתך, אדוננו, הסתכל.
דְּהִיא יָתְבָא בְגוֹ חֲשׁוֹכֵי.
שהיא יושבת בתוך החושך.
וְשַׁנְאָהָא מַלְכֵי וְאִפַרְכֵי.
והשונאים — המלכים והשרים.
אֵיכְדֵין אִתְהַפְּכַת שִׁיטָה:
איך התהפכה הנהגת העולם כך?
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
חִוְיָא דִכְמִין עֲלֵי אֶרְחָא.
נחש האורב על הדרך.
גְרֵי בֵהּ יָת מַלְכָּא מְשִׁיחָא.
מתגרה במלך המשיח.
יִמְחַי יָתֵהּ עֲלֵי מוֹחָא.
המשיח יכה אותו על ראשו.
וְעַל כָּל עַמֵּהּ אַיְתֵי לְוָטָא:
ועל כל עמו יביא קללה ומפלה.
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
זַכְוָן אִי לֵית בִּידָן הַשְׁתָּא.
אם אין בידינו זכויות כעת.
הָא זְכוּתָא דַאֲבָהָתָא.
הרי יש לנו זכות אבות.
וּדְכֵר קַבָּלָא דָאוֹרַיְתָא.
וזכור את קבלת התורה.
וְתוּ אִית סָגִי מִלְתָא דְפְשִׁיטָא:
ויש עוד דבר פשוט וברור.
מְרֵי קְטִירֵי. אַדּוּקֵי שְׁרֵי. שְׁרֵי שַׁדַּר רוֹפִינוֹס דִידַן.
אדון הקשרים, מתיר האסורים! שלח ושחרר את הרפיון והשעבוד שלנו.
אַמַאי אַכַּתֵּי מַטְרוֹנָא דוֹרְמִיטָא. עִדָן עִדָּנִין וּפְלַג מְטָא!
מדוע עדיין השכינה ישנה ונרדמת? הרי הגיע הזמן שנקבע לגאולה!
קְהָלָא קַדִישָׁא הָדֵין.
הקהל הקדוש הזה.
דְאִנּוּן כְּעַן עַבְדִין לְעַבְדִין.
שהם כעת עבדים לעבדים.
כְּנֹס לוֹן תּוּ בְלָא פֵרוּדִין.
כנס אותם שוב בלי פירודים ומחלוקות.
כָּלֵי עָלְמָא רַבָּא וְזוּטָא:
את כל בני העולם, גדולים וקטנים.
