במעמד השתתפו רבנים, תלמידים ובני משפחה, שבאו להעלות על נס את דמותו של ראש הישיבה, אשר הנהגתו החינוכית והציבורית הותירה חותם עמוק בעולם התורה. המעמד נפתח בדברי הגאון הגדול רבי בן ציון מוצפי שליט"א, שעמד על מהפכותיו הרוחניות של חכם שבתי בישיבת "פורת יוסף": ייסוד סדר שלישי קבוע למניעת זליגה למסגרות זרות, החדרת חובת כתיבת חידושי תורה, הדגשת הופעתו של בן תורה בלבוש הראוי, ובעיקר – הדאגה האישית לכל תלמיד ותלמיד במסירות נדירה.
לאחר מכן נשא דברים מרן הראש"ל הגאון רבי דוד יוסף שליט"א, שהדגיש כי כל פועלו של חכם שבתי היה לשם שמים בלבד, ללא כל טובת הנאה. בדבריו תיאר כיצד היה מכתת רגליו ברחבי הארץ להקמת שיעורי תורה, להשתתפות בסיומים ולחיזוק כבוד התורה, וציין כי כך ראה את שליחותו גם בהקמת תנועת ש"ס ורשת תלמודי התורה – הכל מתוך מטרה אחת: להגדיל תורה ולהאדירה.
בדברי הסיום תיאר נכדו, מורינו הרב שליט"א, את מסירות נפשו של סבו לתלמידיו וללימוד התורה, וסיפר על הנהגתו המיוחדת להיכנס לישיבה דרך המרפסת, כדי שלא להפריע לבחורים אפילו לרגע אחד מרצף הלימוד בקימה לכבודו.
בסיום המעמד נאמר קדיש ונערך סיום משניות על ידי בנו, הגאון הגדול רבי ציון אטון שליט"א, ראש ישיבת "ראשית חכמה", כאשר המשתתפים יצאו בתחושת התרוממות וחיזוק בדרכי כיבוד החכמים ומסירות לתורה.
